<div>Dear all wien users</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I want to caculate 2 dimentional graphene electronic structure ,so I make a supercell with C atoms.</div>
<div>I recieve a warning for JRJ like this message in Xnn:</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>WARNING: JRJ of atom&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; is even:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;------????<br>&nbsp; CHANGE it to ODD number !!!!<br>&nbsp;</div>
<div>and if I continue to running,&nbsp;lstart&nbsp;will be stop.</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>My problem at first&nbsp;is that can&nbsp;I change JRJ to ODD number and how?</div>
<div>&nbsp;and second Is my structure correct or no?</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I will be appreciate to any one how can help me .</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Thank you</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>Z.Bagheri</div>
<div>-----------------------------------------------------</div>
<div>my struct file is:</div>
<div>
<p>C </p>
<p>P&nbsp;&nbsp; LATTICE,NONEQUIV.ATOMS:&nbsp; 1 <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;<br>MODE OF CALC=RELA unit=ang <br>&nbsp; <br>4.647806&nbsp; 4.647806 18.897269 90.000000 90.000000 60.000000</p>
<p><br>ATOM&nbsp;&nbsp; 1: X=0.33333333 Y=0.33333333 Z=0.50000000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; MULT= 2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; ISPLIT= 0</p>
<p>ATOM&nbsp;&nbsp; 1:X= 0.66666667 Y=0.66666667 Z=0.50000000<br>C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; R0=0.00010000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.7000&nbsp;&nbsp; Z:&nbsp; 6.0</p>
<p><br>LOCAL ROT MATRIX:<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;</p>
<p><br>&nbsp; 0&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NUMBER OF SYMMETRY OPERATIONS<br></p>
<p>-------------------------------------------------------------------------------------------------</p>
<p>my output file that has warning is:</p>
<p>C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>P&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; RELA<br>&nbsp;<br>&nbsp;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4.647806&nbsp; 4.647806 18.897269&nbsp; 90.000000
 90.000000 60.000000<br>&nbsp;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.33333333&nbsp;&nbsp; 0.33333333&nbsp;&nbsp; 0.50000000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.66666667&nbsp;&nbsp; 0.66666667&nbsp;&nbsp; 0.50000000</p>
<p><br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>C&nbsp; NPT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0&nbsp; R0=0.00010000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.7000&nbsp;&nbsp; Z:&nbsp; 6.0<br>&nbsp;</p>
<p>&nbsp; WARNING: JRJ of atom&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; is even:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; &lt;------????<br>&nbsp; CHANGE it to ODD number !!!!<br>&nbsp;<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<br>&nbsp;</p>
<p>Bravais Matrix:<br>&nbsp;&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.86603&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000</p>
<p>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000</p>
<p>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.00000</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; EQUIV.&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp;&nbsp; 0.33333&nbsp;&nbsp; 0.33333&nbsp;&nbsp; 0.50000<br>&nbsp;<br>RMT(&nbsp; 1)=0.70000 AND RMT(&nbsp; 1)=0.70000<br>&nbsp;<br>SUMS TO 1.40000&nbsp; LT.&nbsp; NN-DIST= 2.68341<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.6667 -0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 
2.68341 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT -0.3333&nbsp; 0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 2.68341 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.6667&nbsp; 0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 2.68341 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT -
0.6667&nbsp; 1.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 1.3333 -0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT -0.6667&nbsp; 0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951
 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.3333 -0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.3333&nbsp; 1.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 1.3333&nbsp; 0.3333
&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; EQUIV.&nbsp; 2&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp;&nbsp; 0.66667&nbsp;&nbsp; 0.66667&nbsp;&nbsp; 0.50000<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.3333&nbsp; 1.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 2.68341 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 1.3333&nbsp; 0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 2.68341
 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.3333&nbsp; 0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 2.68341 A.U.&nbsp;&nbsp; 1.42000 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT -0.3333&nbsp; 1.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 
1.6667 -0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT -0.3333&nbsp; 0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.6667 -0.3333&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951
 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 0.6667&nbsp; 1.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG<br>&nbsp;<br>ATOM:&nbsp; 1&nbsp; C&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; AT&nbsp; 1.6667&nbsp; 0.6667&nbsp; 0.5000 IS&nbsp; 4.64781 A.U.&nbsp;&nbsp; 2.45951 ANG</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>SHELL STRUCTURE for all ATOMS:</p>
<p>ATOM&nbsp; | DISTANCE&nbsp;&nbsp; #of NEIGHBORS&nbsp;&nbsp; Z |<br>&nbsp;</p>
<p>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1 | 2.683&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; 6.0| 4.648&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 6.0| 5.367&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; 6.0| 7.100&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 6.0|<br>&nbsp; <br>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2 | 2.683&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; 6.0| 4.648&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 6.0| 5.367&nbsp; 3&nbsp;&nbsp; 6.0| 7.100&nbsp; 6&nbsp;&nbsp; 6.0|<br>&nbsp;</p>
<p>&nbsp;</p>
<p>LISTING of INDEX of all EQUIVALENT ATOMS:<br>&nbsp;<br>&nbsp;<br>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 are equivalent</p>
<p>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 2 are equivalent<br>&nbsp;</p>
<p>&nbsp;<br>&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp; 2<br></p>
<p>&nbsp;</p></div>