<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<HTML><HEAD><TITLE>Duplicate atoms found Error</TITLE>
<META http-equiv=Content-Type content="text/html; charset=iso-8859-1">
<META content="MSHTML 6.00.2800.1561" name=GENERATOR>
<STYLE></STYLE>
</HEAD>
<BODY bgColor=#ffffff>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hello Nicholas,</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Your structure file is probably wrong. You should 
not have so many atom positions for a cubic structure. You might find an example 
for your space group form 'Examples' in Wien directory.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Hope this helps.</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2>Chandrika</FONT></DIV>
<DIV><FONT face=Arial size=2></FONT>&nbsp;</DIV>
<BLOCKQUOTE 
style="PADDING-RIGHT: 0px; PADDING-LEFT: 5px; MARGIN-LEFT: 5px; BORDER-LEFT: #000000 2px solid; MARGIN-RIGHT: 0px">
  <DIV style="FONT: 10pt arial">----- Original Message ----- </DIV>
  <DIV 
  style="BACKGROUND: #e4e4e4; FONT: 10pt arial; font-color: black"><B>From:</B> 
  <A title=dimakis@husky.panam.edu 
  href="mailto:dimakis@husky.panam.edu">Nicholas Dimakis</A> </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>To:</B> <A 
  title=wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at 
  href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</A> 
  </DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Sent:</B> Thursday, October 26, 2006 3:47 
  AM</DIV>
  <DIV style="FONT: 10pt arial"><B>Subject:</B> [Wien] Duplicate atoms found 
  Error</DIV>
  <DIV><BR></DIV><!-- Converted from text/plain format --><BR><BR>
  <P><FONT size=2>Hello<BR>I am trying to test wien2k on a Pt (100) cluster. I 
  used Fm-3m as space group,<BR>a=b=c=3.92 Angs as lattice parameters. This is 
  the part of output of outputnn program.<BR><BR><BR><BR>&nbsp;NAMED ATOM: 
  Pt1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to IATNR+999 to determine 
  equivalency<BR>Pt1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 
  781&nbsp; R0=0.00000500 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 
  78.0<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 1.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 1.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 
  0.50000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1<BR>&nbsp;NAMED ATOM: Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to 
  IATNR+999 to determine 
  equivalency<BR>Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 
  781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 
  78.0<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.00000000&nbsp;&nbsp; 
  0.50000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1<BR>&nbsp;NAMED ATOM: Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to 
  IATNR+999 to determine 
  equivalency<BR>Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 
  781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 
  78.0<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 
  0.00000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1<BR>&nbsp;NAMED ATOM: Pt4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to 
  IATNR+999 to determine 
  equivalency<BR>Pt4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 
  781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 
  78.0<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 
  0.0000000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>&nbsp;Bravais 
  Matrix:<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000<BR>&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  0.00000<BR><BR>................................<BR>................................<BR><BR><BR><BR>LISTING 
  of INDEX of all EQUIVALENT ATOMS:<BR><BR>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 and 
  ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 are equivalent<BR><BR>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 2 and 
  ATOM:&nbsp;&nbsp; 2 are equivalent<BR><BR>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 3 and 
  ATOM:&nbsp;&nbsp; 3 are equivalent<BR><BR>&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 4 and 
  ATOM:&nbsp;&nbsp; 4 are equivalent<BR><BR><BR>&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 
  1&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 
  1<BR><BR>&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; OLD and NEW 
  MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR><BR>&nbsp;ATOM 
  KIND:&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 
  1&nbsp;&nbsp; 1<BR><BR>&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 4&nbsp; OLD and NEW 
  MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR><BR><BR><BR>But when 
  i run x sgroup i get<BR><BR><BR>Error: duplicated atoms found! Atoms #1 and #2 
  coincide.<BR>Error: duplicated atoms found! Atoms #1 and #2 coincide.<BR>diff: 
  Pt_test.outputsgroup: No such file or directory<BR>diff: 
  Pt_test.outputsgroup1: No such file or directory<BR>Error: duplicated atoms 
  found! Atoms #1 and #2 coincide.<BR>0.000u 0.000s 0:00.00 
  0.0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0+0k 0+0io 0pf+0w<BR>error: 
  command&nbsp;&nbsp; /home/user1/Wien2k/sgroup -wi Pt_test.struct -wo 
  Pt_test.struct_sgroup&nbsp; -set-TOL=0.00001&nbsp;&nbsp; 
  failed<BR><BR><BR><BR><BR>Any ideas 
  ?<BR><BR><BR>Thanks<BR><BR><BR><BR><BR><BR><BR>Nikolaos Dimakis<BR>Assistant 
  Professor<BR>Physics and Geology<BR>University of Texas-Pan 
  American<BR><BR></FONT></P>
  <P>
  <HR>

  <P></P>_______________________________________________<BR>Wien mailing 
  list<BR>Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at<BR>http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien<BR></BLOCKQUOTE></BODY></HTML>