
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 3.2//EN">

<HTML>

<HEAD>

<META HTTP-EQUIV="Content-Type" CONTENT="text/html; charset=iso-8859-1">

<META NAME="Generator" CONTENT="MS Exchange Server version 6.5.7638.1">

<TITLE>Duplicate atoms found Error</TITLE>

</HEAD>

<BODY>

<!-- Converted from text/plain format -->

<BR>

<BR>


<P><FONT SIZE=2>Hello<BR>

I am trying to test wien2k on a Pt (100) cluster. I used Fm-3m as space group,<BR>

a=b=c=3.92 Angs as lattice parameters. This is the part of output of outputnn program.<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

&nbsp;NAMED ATOM: Pt1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to IATNR+999 to determine equivalency<BR>

Pt1&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 781&nbsp; R0=0.00000500 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 78.0<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 1.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 1.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<BR>

&nbsp;NAMED ATOM: Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to IATNR+999 to determine equivalency<BR>

Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 78.0<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 3&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.00000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<BR>

&nbsp;NAMED ATOM: Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to IATNR+999 to determine equivalency<BR>

Pt2&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 78.0<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 4&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.50000000&nbsp;&nbsp; 0.00000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1<BR>

&nbsp;NAMED ATOM: Pt4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; Z changed to IATNR+999 to determine equivalency<BR>

Pt4&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; NPT=&nbsp; 781&nbsp; R0=0.00050000 RMT=&nbsp;&nbsp;&nbsp; 2.5000&nbsp;&nbsp; Z: 78.0<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.0000000 0.0000000 0.0000000<BR>

&nbsp;Bravais Matrix:<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000<BR>

&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.50000&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0.00000<BR>

<BR>

................................<BR>

................................<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

LISTING of INDEX of all EQUIVALENT ATOMS:<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 1 are equivalent<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 2 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 2 are equivalent<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 3 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 3 are equivalent<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM:&nbsp;&nbsp; 4 and ATOM:&nbsp;&nbsp; 4 are equivalent<BR>

<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 1&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 2&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 3&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR>

<BR>

&nbsp;ATOM KIND:&nbsp;&nbsp; 4&nbsp; OLD and NEW MULTIPLICITY:&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 1&nbsp;&nbsp; 1<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

But when i run x sgroup i get<BR>

<BR>

<BR>

Error: duplicated atoms found! Atoms #1 and #2 coincide.<BR>

Error: duplicated atoms found! Atoms #1 and #2 coincide.<BR>

diff: Pt_test.outputsgroup: No such file or directory<BR>

diff: Pt_test.outputsgroup1: No such file or directory<BR>

Error: duplicated atoms found! Atoms #1 and #2 coincide.<BR>

0.000u 0.000s 0:00.00 0.0%&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; 0+0k 0+0io 0pf+0w<BR>

error: command&nbsp;&nbsp; /home/user1/Wien2k/sgroup -wi Pt_test.struct -wo Pt_test.struct_sgroup&nbsp; -set-TOL=0.00001&nbsp;&nbsp; failed<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

Any ideas ?<BR>

<BR>

<BR>

Thanks<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

<BR>

Nikolaos Dimakis<BR>

Assistant Professor<BR>

Physics and Geology<BR>

University of Texas-Pan American<BR>

<BR>

</FONT>

</P>


</BODY>

</HTML>