Dear all wien2k users<br><br>I have two problems I have questions on.
The first is about the Structgen program. For me it has seems to mess
up with layered type of compounds.<br>When looking at compounds like
LiCoO2 it seems to put the atoms too close together. When I input the
positions I do not leave any values out so it should have enough Sig
Figs to calculate the proper positions.<br>
<br>The LiCoO2.struct file is:<br><br>blebleble <div> <br>R LATTICE,NONEQUIV.ATOMS: 5166_R-3m <br>MODE OF CALC=RELA unit=bohr<br> 5.336587 5.336587 26.244517 90.000000 90.000000120.000000<br>
ATOM -1: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000<br> MULT= 1 ISPLIT= 8<br>Li1+ NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 2.0000 Z: 3.0<br>LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 1.0000000 0.0000000<br>
0.0000000 0.0000000 1.0000000<br>ATOM -2: X=0.83333334 Y=0.66666667 Z=0.16666667<br> MULT=12 ISPLIT= 8<br>ATOM -2:X= 0.16666666 Y=0.33333333 Z=0.83333333<br>ATOM -2:X= 0.66666667 Y=0.16666667 Z=0.83333334<br>
ATOM -2:X= 0.33333333 Y=0.83333333 Z=0.16666666<br>ATOM -2:X= 0.83333334 Y=0.16666667 Z=0.66666667<br>ATOM -2:X= 0.16666666 Y=0.83333333 Z=0.33333333<br>ATOM -2:X= 0.16666667 Y=0.83333334 Z=0.66666667<br>ATOM -2:X= 0.83333333 Y=0.16666666 Z=0.33333333<br>
ATOM -2:X= 0.16666667 Y=0.66666667 Z=0.83333334<br>ATOM -2:X= 0.83333333 Y=0.33333333 Z=0.16666666<br>ATOM -2:X= 0.66666667 Y=0.83333334 Z=0.16666667<br>ATOM -2:X= 0.33333333 Y=0.16666666 Z=0.83333333<br>Li1+ NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 2.0000 Z: 3.0<br>
LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 1.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 0.0000000 1.0000000<br>ATOM -3: X=0.00000000 Y=0.00000000 Z=0.00000000<br> MULT= 1 ISPLIT= 8<br>
Co3+ NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 2.0000 Z: 27.0<br>LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 1.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 0.0000000 1.0000000<br>
ATOM -4: X=0.83333334 Y=0.66666667 Z=0.16666667<br> MULT=12 ISPLIT= 8<br>ATOM -4:X= 0.16666666 Y=0.33333333 Z=0.83333333<br>ATOM -4:X= 0.66666667 Y=0.16666667 Z=0.83333334<br>ATOM -4:X= 0.33333333 Y=0.83333333 Z=0.16666666<br>
ATOM -4:X= 0.83333334 Y=0.16666667 Z=0.66666667<br>ATOM -4:X= 0.16666666 Y=0.83333333 Z=0.33333333<br>ATOM -4:X= 0.16666667 Y=0.83333334 Z=0.66666667<br>ATOM -4:X= 0.83333333 Y=0.16666666 Z=0.33333333<br>ATOM -4:X= 0.16666667 Y=0.66666667 Z=0.83333334<br>
ATOM -4:X= 0.83333333 Y=0.33333333 Z=0.16666666<br>ATOM -4:X= 0.66666667 Y=0.83333334 Z=0.16666667<br>ATOM -4:X= 0.33333333 Y=0.16666666 Z=0.83333333<br>Co3+ NPT= 781 R0=0.00005000 RMT= 2.0000 Z: 27.0<br>
LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000<br>
0.0000000 1.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 0.0000000 1.0000000<br>ATOM -5: X=0.74863333 Y=0.49726667 Z=0.25136667<br> MULT=12 ISPLIT= 8<br>ATOM -5:X= 0.25136667 Y=0.50273333 Z=0.74863333<br>
ATOM -5:X= 0.49726667 Y=0.25136667 Z=0.74863333<br>ATOM -5:X= 0.50273333 Y=0.74863333 Z=0.25136667<br>ATOM -5:X= 0.74863333 Y=0.25136667 Z=0.49726667<br>ATOM -5:X= 0.25136667 Y=0.74863333 Z=0.50273333<br>ATOM -5:X= 0.25136667 Y=0.74863333 Z=0.49726667<br>
ATOM -5:X= 0.74863333 Y=0.25136667 Z=0.50273333<br>ATOM -5:X= 0.25136667 Y=0.49726667 Z=0.74863333<br>ATOM -5:X= 0.74863333 Y=0.50273333 Z=0.25136667<br>ATOM -5:X= 0.49726667 Y=0.74863333 Z=0.25136667<br>ATOM -5:X= 0.50273333 Y=0.25136667 Z=0.74863333<br>
O 2- NPT= 781 R0=0.00010000 RMT= 2.0000 Z: 8.0<br>LOCAL ROT MATRIX: 1.0000000 0.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 1.0000000 0.0000000<br> 0.0000000 0.0000000 1.0000000<br>
0 NUMBER OF SYMMETRY OPERATIONS<br><br>If you look at it in
xcrysden, there are lithium atoms, and oxygen atoms on top of each other
(like mentioned before). I have tried to replace the the present
executetables with the precompiled executables one can download because I
thought it may have compiled them wrong. I have no problems with any
other type of structures; layered structures are the only ones that seem
to mess up.<br>
I have tower with 4 six-core Xeon processors, 48gb running Ubuntu 12.04.
Wien2K 11.1 was compiled with gfortran 4.6.3 with the GotoBLAS
library. What can I do?<br><br>The second question I have is, Do I need
an MPI and ScaLAPACK libraries to fully utilize my hardware for
calculations? Or do I not need them because all of my hardware is on
the same machine? I am a bit confused by the information in the user
guide. <br>
<br>Help with both of the questions would be much appreciated.<br><br>Josh Davis</div>