<div dir="ltr">Close, see inlined<div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Thu, Apr 23, 2015 at 9:33 AM, Madesis Ioannis(John) <span dir="ltr"><<a href="mailto:imadesis@physics.uoc.gr" target="_blank">imadesis@physics.uoc.gr</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">> Laurence Marks Thu, 23 Apr 2015 06:29:49 -0700<br>
><br>
> Please look in the UG at clmextrapol, and also what is done in the<br>
> optimize.job script created by x optimize. The clmextrapol utility is<br>
> designed for this type of issue.<br>
<br>
Thank you for your answer.<br>
I am currently reading the user guide, and it seems really promising,<br>
however, I am confused on the course of action for my case. Since the<br>
extrapol_lapw command doesn't have any arguments, I try to figure the<br>
necessary steps for its use.<br>
<br>
Assuming I have completed my run for YBCO-008 and prepare for the<br>
YBCO-009:<br>
<br>
1)I copy YBCO-008/YBCO-008.clmsum_old  to YBCO-009/YBCO-009.clmsum_old<br></blockquote><div><br></div><div>No, cp YBCO-008/YBCO-008.clmsum YBCO-009/YBCO-009.clmsum</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
2)I copy YBCO-008/new_super.clmsum to YBCO-009/new_super.clmsum   (not<br>
quite sure)<br></blockquote><div><br></div><div>Correct, assuming that you did not relax YBCO-008 (which I believe you did not)</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
3)Change directory to YBCO-009/ (It is ALREADY initiallized)<br></blockquote><div><br></div><div>Yes </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
4)Run clmextrapol_lapw<br></blockquote><div><br></div><div>Yes </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
5)Run run_lapw etc,etc<br></blockquote><div><br></div><div>Yes </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
<br>
Are these steps sufficient for the proper CLM transfer?<br></blockquote><div><br></div><div>Yes. You will save some iterations.</div><div><br></div><div>As an addendum, if 001-00X etc are all different displacements, and 000 is the initial structure without displacements it can be as good (perhaps better) to do in all cases</div><div>cp _000/YBCO-000/new_super.clmsum 00X ; cp cp _000/YBCO-000/YBCO-000.clmsum 000 00X/YBCO-00X.clmsum</div><div>clmextrapol</div><div><br></div><div>You can even do this with a do loop in bash/csh at the start.</div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">
_______________________________________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Professor Laurence Marks<br>Department of Materials Science and Engineering<br>Northwestern University<br><a href="http://www.numis.northwestern.edu" target="_blank">www.numis.northwestern.edu</a><div>Corrosion in 4D: <a href="http://MURI4D.numis.northwestern.edu" target="_blank">MURI4D.numis.northwestern.edu</a><br>Co-Editor, Acta Cryst A<br>"Research is to see what everybody else has seen, and to think what nobody else has thought"<br>Albert Szent-Gyorgi</div></div></div>
</div></div>