<p dir="ltr">This discussion appears to be useful, and hopefully the structures people are sending will help.</p>
<p dir="ltr">That said, there is one deeper issue with this thread. If the intent is to calculate a thin hydrogen terminated silicon layer for which there is experimental data then the model(s) are reasonable. It is also relevant if the idea is to learn about surface calculations.</p>
<p dir="ltr">However, if the intent is to model a hydrogen terminated Si (001) surface it is extremely unlikely that any of the models are relevant.</p>
<p dir="ltr">---<br>
Professor Laurence Marks<br>
Department of Materials Science and Engineering<br>
Northwestern University<br>
<a href="http://www.numis.northwestern.edu">http://www.numis.northwestern.edu</a><br>
Corrosion in 4D <a href="http://MURI4D.numis.northwestern.edu">http://MURI4D.numis.northwestern.edu</a><br>
Co-Editor, Acta Cryst A<br>
"Research is to see what everybody else has seen, and to think what nobody else has thought"<br>
Albert Szent-Gyorgi</p>
<div class="gmail_quote">On Jul 20, 2015 08:54, "delamora" <<a href="mailto:delamora@unam.mx">delamora@unam.mx</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Here I send a possible structure, but it needs optimization.</p>
<p><br>
</p>
<p>                Pablo de la Mora<br>
</p>
<br>
<br>
<div style="color:rgb(0,0,0)">
<hr style="display:inline-block;width:98%">
<div dir="ltr"><font style="font-size:11pt" color="#000000" face="Calibri, sans-serif"><b>De:</b> <a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a> <<a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>> en nombre de Muhammad Sajjad <<a href="mailto:sajjadpu@gmail.com" target="_blank">sajjadpu@gmail.com</a>><br>
<b>Enviado:</b> lunes, 20 de julio de 2015 04:22 a. m.<br>
<b>Para:</b> A Mailing list for WIEN2k users<br>
<b>Asunto:</b> Re: [Wien] Metallic Behavior of Si 100 layer</font>
<div> </div>
</div>
<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div>
<div>
<div>
<div>Dear Delamore and Oleg<br>
</div>
Thank you very much for your kind suggestions. <br>
<br>
@Delamore: The attached structure is in fine symmetry and I am trying this for further calculations and will update once done with the calculations.<br>
<br>
</div>
@Oleg: I understood your point. Dangling bonds and less than required Si-Si distance are prominent reason of sending the Si 100 in metallic category. Could you please guide me how to add second H atom at the surface with Si? If possible please add the structure
 your made.<br>
<br>
</div>
True Regards<br>
</div>
M. Sajjad<br>
</div>
KAUST, KSA.  <br>
<div>
<div>
<div>
<div><br>
</div>
</div>
</div>
</div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote">On Mon, Jul 20, 2015 at 12:08 AM, Oleg Rubel <span dir="ltr">
<<a href="mailto:orubel@lakeheadu.ca" target="_blank">orubel@lakeheadu.ca</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
In addition to that: The surface is truncated in a way that each Si has *two* dangling bonds. Thus two H-atoms per one Si at the surface are needed to passivate dangling bonds. I enclosed a sketch (I hope it will come through) where the proposed changes are
 shown for one Si atom. Note that the H-atoms are oriented to keep tetrahedral coordination of Si.<br>
<br>
I hope it will help<br>
Oleg<br>
<span><br>
>> On Jul 19, 2015, at 3:00 PM, delamora <<a href="mailto:delamora@unam.mx" target="_blank">delamora@unam.mx</a>> wrote:<br>
>><br>
>> Sorry, I wanted to say "symmetrize"<br>
>><br>
>><br>
</span><span>>> De: <a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">
wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a> <<a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>> en nombre de delamora <<a href="mailto:delamora@unam.mx" target="_blank">delamora@unam.mx</a>><br>
>> Enviado: domingo, 19 de julio de 2015 02:56 p. m.<br>
>> Para: A Mailing list for WIEN2k users<br>
>> Asunto: Re: [Wien] Metallic Behavior of Si 100 layer<br>
>><br>
>> If you systematize your system you will have a much simpler problem;<br>
>> Here in the SiH100.struct I moved the central plane to 0 0 1/2, then I averaged the positions of the atoms above the plane and the equivalent atom below this plane.<br>
>> After this "sgroup" changed the structure to a simpler and more symmetric one.<br>
>><br>
>> Now, here you have 4 Si layers, maybe you can grow the thickness of your system.<br>
>><br>
>> Pablo<br>
>><br>
>><br>
</span><span>>> De: <a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">
wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a> <<a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>> en nombre de Muhammad Sajjad <<a href="mailto:sajjadpu@gmail.com" target="_blank">sajjadpu@gmail.com</a>><br>
>> Enviado: domingo, 19 de julio de 2015 06:16 a. m.<br>
>> Para: A Mailing list for WIEN2k users<br>
>> Asunto: Re: [Wien] Metallic Behavior of Si 100 layer<br>
>><br>
>> Thank you Oleg, the structure file is attached herewith.<br>
>><br>
</span><span>>> On Sun, Jul 19, 2015 at 3:05 PM, Oleg Rubel <<a href="mailto:orubel@lakeheadu.ca" target="_blank">orubel@lakeheadu.ca</a>> wrote:<br>
>> Including the  structure file would be helpful.<br>
>> Oleg<br>
</span><span>>> On Jul 19, 2015 12:24 AM, "Muhammad Sajjad" <<a href="mailto:sajjadpu@gmail.com" target="_blank">sajjadpu@gmail.com</a>> wrote:<br>
>> Dear User<br>
>> After relaxation, the Si 100 layer saturated with H  is behaving like a metal. I am unable to find its reason or some wrong approach followed in my calculations. Could you please guide me?<br>
>><br>
>> Many thanks<br>
>> Muhammad Sajjad<br>
>><br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> Wien mailing list<br>
</span>>> <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<span>>> <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">
http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>> SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
>><br>
>><br>
</span>>> _______________________________________________<br>
>> Wien mailing list<br>
>> <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<span>>> <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">
http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>> SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>><br>
</span><span>>> --<br>
>> Kind Regards<br>
>> Muhammad Sajjad<br>
>> Post Doctoral Fellow<br>
>> KAUST, KSA.<br>
</span>>> _______________________________________________<br>
>> Wien mailing list<br>
>> <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<span>>> <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">
http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>> SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
</span>> <Si-surface.pdf><br>
<br>
_______________________________________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<div>
<div><a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">
http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
</div>
</div>
</blockquote>
</div>
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<br clear="all">
<br>
-- <br>
<div>
<div dir="ltr">
<div>Kind Regards</div>
<div>Muhammad Sajjad </div>
<div>Post Doctoral Fellow</div>
<div>KAUST, KSA.</div>
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</blockquote></div>