<div dir="ltr">You have what is called a "Segmentation Violation" which was detected by 4 of the nodes and they called an error handler which stopped the mpi job on all the CPU's.<div><br></div><div>This is normally because you have an error of some sort in your input files, any of case.in0, case.clmsum (and clmup/dn if you are using spin polarized).</div><div><br></div><div>1) Check that you do not have overlapping spheres and/or other mistakes.</div><div>2) Check your error files, e.g. "cat *.error". Are any others (e.g. dstart.error) not empty? Did you ignore an error during setup?</div><div>3) Check the lapw0 output in case.output0* -- maybe shows what is wrong.</div><div><br></div><div>There are many possible sources, you have to find the specific one.</div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Jul 28, 2015 at 12:57 PM, Lan, Wangwei <span dir="ltr"><<a href="mailto:wl13c@my.fsu.edu" target="_blank">wl13c@my.fsu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-size:12pt;color:#000000;background-color:#ffffff;font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif">
<p>Dear WIEN2k user:</p>
<p><br>
</p>
<p>I am using wien2k_14.2 on CentOS release 5.8. ifort version 12.1.3 with MKL. </p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>After generating a 2x2x1 supercell with 30 atoms, I tried to do the scf calculation. However, I got some errors. I'v attached it at the end of this email. My wien2k was installed correctly. It works well for other calculations. It also worked if I run non-parallel
 calculation for supercell. I'v searched the mail-list, but can't find any solutions. Could you give me a hint on how to solve the problem? Thank you very much.</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>Sincerely </p>
<p>Wangwei Lan</p>
<p><br>
</p>
<p><span style="font-size:12pt"><br>
</span></p>
<p><span style="font-size:12pt">On lapw0.error shows:</span><br>
</p>
<p> </p>
<p><span style="font-size:12pt">'Unknown' - SIGSEGV</span><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p><br>
</p>
<p>On super.dayfile shows:</p>
<p><br>
</p>
<p>Child id           0 SIGSEGV</p>
<p> Child id           8 SIGSEGV</p>
<p> Child id          18 SIGSEGV</p>
<p> Child id          23 SIGSEGV</p>
<p> Child id          17 SIGSEGV</p>
<div><br>
</div>
<div><br>
</div>
<p><br>
</p>
<p>On Screen shows:</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>w2k_dispatch_signal(): received: Segmentation fault</p>
<p>--------------------------------------------------------------------------</p>
<p>MPI_ABORT was invoked on rank 18 in communicator MPI_COMM_WORLD </p>
<p>with errorcode 451782144.</p>
<p><br>
</p>
<p>NOTE: invoking MPI_ABORT causes Open MPI to kill all MPI processes.</p>
<p>You may or may not see output from other processes, depending on</p>
<p>exactly when Open MPI kills them.</p>
<p>--------------------------------------------------------------------------</p>
<p>--------------------------------------------------------------------------</p>
<p>mpirun has exited due to process rank 18 with PID 26388 on</p>
<p>node <a href="http://corfu.magnet.fsu.edu" target="_blank">corfu.magnet.fsu.edu</a> exiting without calling "finalize". This may</p>
<p>have caused other processes in the application to be</p>
<p>terminated by signals sent by mpirun (as reported here).</p>
<p>--------------------------------------------------------------------------</p>
<p>[<a href="http://corfu.magnet.fsu.edu:26369" target="_blank">corfu.magnet.fsu.edu:26369</a>] 23 more processes have sent help message help-mpi-api.txt / mpi-abort</p>
<p>[<a href="http://corfu.magnet.fsu.edu:26369" target="_blank">corfu.magnet.fsu.edu:26369</a>] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages</p>
<p><br>
</p>
<p>>   stop error</p>
<p><br>
</p>
<div><br>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">Professor Laurence Marks<br>Department of Materials Science and Engineering<br>Northwestern University<br><a href="http://www.numis.northwestern.edu" target="_blank">www.numis.northwestern.edu</a><div>Corrosion in 4D: <a href="http://MURI4D.numis.northwestern.edu" target="_blank">MURI4D.numis.northwestern.edu</a><br>Co-Editor, Acta Cryst A<br>"Research is to see what everybody else has seen, and to think what nobody else has thought"<br>Albert Szent-Gyorgi</div></div></div>
</div>