
<html>


<head>


<style><!--


.hmmessage P


{


margin:0px;


padding:0px


}


body.hmmessage


{


font-size: 12pt;


font-family:微软雅黑


}


--></style></head>


<body class='hmmessage'><div dir='ltr'>Dear Everyone,<br><br>During installing WIEN2k_14.2, I watched the screen and saw a few errors in the following.  I am not sure it is OK or not.<br>-------after save compiler options-------------------<br>No Makefile.orig in SRC_structeditor/SRC_lib, leaving directory.<br>No Makefile.orig in SRC_BerryPI, leaving directory. <br>No Makefile.orig in SRC_lib, leaving directory. <br>No Makefile.orig in SRC_structeditor, leaving directory.<br>No Makefile.orig in SRC_templates, leaving directory.<br> No Makefile.orig in SRC_usersguide_html, leaving directory.<br>No Makefile.orig in SRC_w2web, leaving directory.<br>---------During compiling---------------------<br>RC_BerryPI ...<br>make: *** No rule to make target `clean'.  Stop.<br>make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.<br><br>SRC_clmcopy ...<br>make: Circular modules.o <- modules.o dependency dropped.<br>make: Circular reallocate.o <- modules.o dependency dropped.<br>make: Circular reallocate.o <- reallocate.o dependency dropped.<br><br>make[1]: Leaving directory `/usr/local/WIEN2k_14.2/SRC_dstart'<br>make: *** No rule to make target `complex'.  Stop.<br>-----------------------------------<br><br>Waiting for solution.<br>Thanks!<br><br>WT<br><br>+++++++++++Here is my situation and installation process++++++++++++++++<br><br>1. Hardware: A simple cluster with TWO DELL T760/T7600 workstations communicating through 1000M switch: <br>Master (node1)--- 2*Xeon E5-2690 (2*8core), 128G memory<br>Slave (node2) ---- 2*Xeon E5-2690 v2 (2*10core), 64G memory<br>---Installation is on Master.<BR><div><div dir="ltr">2. OS: CentOS 6.5 64bit final</div><div dir="ltr">3. Required package installed <br>F90 compiler ----Intel parallel_studio_xe_2013_update4 inluding ifort version 13.1.3, icc version 13.1.3, MKL, installed at /opt/intel<br>perl 5  ---- v5.10.1 installed at  /usr/bin/perl)<br>emacs --- GNU Emacs 23.1.1 installed at /usr/bin/emacs）<br>ghostscript ---- v8.70 installed at /usr/bin/ghostscript) <br>gnuplot ----- gnuplot 4.2 patchlevel 6 installed at /usr/bin/gnuplot ）<br>www-browser ----- firefox 38.2.1 installed<br>Tcl/Tk-Toolkit ----- tcl.x86_64/tk.x86_64 v8.5.7 installed<br>FFTW v.2 or 3 -----Both installed with yum (fftw2-2.1.5, fftw-3.2.1), <br>                  and also installed fftw3.3.4 from source through <br>                  "./configure --prefix=/usr/local/fftw3.3.4 CC="icc" --enable-mpi --enable-threads"<br>                  and "make", "make install" at /usr/local/fftw3.3.4 with parallel available.<br>MPI+SCALAPACK -----Yum installed mpich-3.1-4, openmpi-1.8.1, scalapack-common-2.0.2, scalapack-openmpi-2.0.2,scalapack-mpich-2.0.2,blacs-common-2.0.2,blacs-mpich-2.0.2, blacs-openmpi-2.0.2<br>                   Also mpich-3.1 was installed from source  at /usr/local/mpich3_intel13 (compiled with ifort13 and icc13 compiler)****This mpich path is indicated in the bashrc and profile*****</div><div dir="ltr">Python ---- Python 2.6.6 (with numpy1.4) came with OS, <br>            Python 2.7.3 installed at /usr/local/lib/python2.7, /usr/local/bin<br>            New Numpy 1.8.0 was uninstalled, and Numpy 1.6.2 was installed with Python 2.7.3.</div><div dir="ltr">Intel MKL-fft ----Intel MKL-fft was compiled through "make libintel64 F=intel precision=MKL_DOUBLE" at /opt/intel/mkl/interfaces/xxxxx (xxxx=fftw2xc  fftw2xf  fftw3xc fftw3xf)</div><div dir="ltr">4. Install WIEN2k_14.2  <br>mkdir "WIEN2k_14.2" at /usr/local/<br>copy Fccni.tar.gz  TiC.tar.gz  TiO2.tar.gz  WIEN2k_14.2.tar to /usr/local/WIEN2k_14.2, then:</div><div dir="ltr"># tar -xvf WIEN2k_14.2.tar <br># gunzip *.gz<br># chmod +x ./expand_lapw<br># ./expand_lapw </div><div dir="ltr">***Everything is unpacked except Fccni.tar*****, then<br># tar -xf Fccni.tar</div><div dir="ltr"># ./siteconfig_lapw</div><div dir="ltr">   **********************<br>   *  Specify a system  *<br>   **********************<br> Selection: I<br> <br>   ***********************<br>   *  Specify compilers  *<br>   ***********************<br>Your Fortran compiler will be ifort.<br>Your C compiler will be cc.</div><div dir="ltr">   ******************************<br>   *  Specify compiler options  *<br>   ******************************<br>searching ....<br>You have the following mkl libraries in /opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64 :<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_ilp64.so<br>......<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_lapack95_ilp64.a<br>MKL_TARGET_ARCH was set to intel64<br>The default options shown on the next screen should be ok<br>Hit Enter to continue </div><div dir="ltr">Current settings:<br> O   Compiler options:        -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -ip -DINTEL_VML -O3 -xW<br> F   FFTW options:            <br> L   Linker Flags:            $(FOPT) -L/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/ -pthread -i-static<br> P   Preprocessor flags       '-DParallel'<br> R   R_LIB (LAPACK+BLAS):     -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_intel_thread -lmkl_core -openmp -lpthread<br> FL  FFTW_LIBS:               -lfftw3_mpi -lfftw3 -L/usr/local/fftw3_intel12_mpich3/lib<br> S   Save and Quit</div><div dir="ltr">  *******************************<br>   *  Changing compiler options  *<br>   *******************************</div><div dir="ltr">    changing Makefile in SRC_lib/blas_lapw<br>    changing Makefile in SRC_lib/lapack_lapw<br>    No Makefile.orig in SRC_structeditor/SRC_lib, leaving directory.  (*****There are several this statement,No Makefile.orig****** )<br>    .....<br>    No Makefile.orig in SRC_BerryPI, leaving directory.    <br>    ......<br>    No Makefile.orig in SRC_lib, leaving directory. <br>    ......<br>    No Makefile.orig in SRC_structeditor, leaving directory.  <br>    ......<br>    No Makefile.orig in SRC_templates, leaving directory.  <br>    ......<br>    No Makefile.orig in SRC_usersguide_html, leaving directory.  <br>   .......<br>    No Makefile.orig in SRC_w2web, leaving directory. </div><div dir="ltr">   **********************************<br>   *  Configure parallel execution  *<br>   **********************************  <br>  Shared Memory Architecture? (y/N):N<br>  If you are using mpi2 set MPI_REMOTE to 0<br>  Set MPI_REMOTE to  0 / 1: 1</div><div dir="ltr">   **********************************<br>   *  Configure parallel execution  *<br>   **********************************<br>     Remote shell (default is ssh) = ssh<br>  <br> ********************************************************<br>     You need to KNOW details about your installed  MPI and FFTW )</div><div dir="ltr">   (y/n) y<br>      Your compiler: mpif90</div><div dir="ltr"><br> Finding the required fftw2/3 mpi-files in /usr and /opt ....<br> <br>/usr/local/fftw3.3.4/lib/libfftw3_mpi.a<br>could not find fftw ....           (*************here I don't know why not found**********)<br>Your present FFTW choice is:   <br>Please specify whether you want to use FFTW3 (default) or FFTW2  (FFTW3 / FFTW2): FFTW3</div><div dir="ltr">Present FFTWpath is:  <br>Please specify the ROOT-path of your FFTW installation (like /opt/fftw3): /usr/local/fftw3.3.4<br> <br>Your FFTW_LIBS are: -lfftw3_mpi -lfftw3 -L/usr/local/fftw3.3.4/lib <br>Your FFTW_OPT are : -DFFTW3 -I/usr/local/fftw3.3.4/include <br> <br>is this correct? enter Y (default) or n: Y</div><div dir="ltr">The blacs-library depends on the version of your mpi (intelmpi, openmpi,<br>sgimpi, others) and you have to specify the proper blacs-library<br>in /opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64 you have the following blacs libraries:<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.a<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_intelmpi_lp64.so<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_openmpi_lp64.a<br>/opt/intel/composer_xe_2013.5.192/mkl/lib/intel64/libmkl_blacs_sgimpt_lp64.a<br>   Current settings:</div><div dir="ltr">     FFTW_LIB + FFTW_OPT    : -lfftw3_mpi -lfftw3 -L/usr/local/fftw3.3.4/lib  +  -DFFTW3 -I/usr/local/fftw3.3.4/include (already set)<br>     RP  RP_LIB(SCALAPACK+PBLAS): -lmkl_scalapack_lp64 -lmkl_blacs_lp64 $(R_LIBS) <br>     FP  FPOPT(par.comp.options): $(FOPT)<br>     MP  MPIRUN commando        : mpirun -np _NP_ -machinefile _HOSTS_ _EXEC_</div><div dir="ltr"> <br>   *******************************<br>   *  Changing compiler options  *<br>   *******************************<br>    changing Makefile in SRC_lapw0<br>    changing Makefile in SRC_lapw1<br>    changing Makefile in SRC_lapw2<br>    changing Makefile in SRC_hf<br>    changing Makefile in SRC_dstart<br>    changing Makefile in SRC_lapwso<br>    changing Makefile in SRC_nmr</div><div dir="ltr">   ***********************************<br>   *    (Re-)Dimension parameters    *<br>   ***********************************<br>set value for NMATMAX=320000<br>set value for NUME=32000</div><div dir="ltr">   ************************************<br>   *    Compile/Recompile programs    *<br>   ************************************</div><div dir="ltr">      A   Compile all programs (suggested)</div><div dir="ltr">      Selection: A<br>**********I watched the screen and saw a few errors in the following*****************<br>RC_BerryPI ...<br>make: *** No rule to make target `clean'.  Stop.<br>make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.</div><div dir="ltr">SRC_clmcopy ...<br>rm  -f clmcopy.o modules.o  reallocate.o struct_afm_check.o readstruct.o writestruct.o outerr.o  *.mod<br>ifort  -FR -mp1 -w -prec_div -pc80 -pad -ip -DINTEL_VML -O3 -xW   -c clmcopy.f<br>make: Circular modules.o <- modules.o dependency dropped.<br>make: Circular reallocate.o <- modules.o dependency dropped.<br>make: Circular reallocate.o <- reallocate.o dependency dropped.</div><div dir="ltr">ifort: command line remark #10010: option '-pthread' is deprecated and will be removed in a future release. See '-help deprecated'<br>make[1]: Leaving directory `/usr/local/WIEN2k_14.2/SRC_dstart'<br>make: *** No rule to make target `complex'.  Stop.</div><div dir="ltr">......<br>Copying programs<br>  SRC_afminput/afminput<br>  ......<br>  SRC_BerryPI/BerryPI<br>cp: omitting directory `SRC_BerryPI/BerryPI'<br>  SRC_broadening/broadening<br>  .....<br>  SRC_w2w/w2w<br>  SRC_w2w/w2wc<br>  SRC_w2web/w2web<br>cp: `SRC_w2web/w2web' and `/usr/local/WIEN2k_14.2/w2web' are the same file<br>  SRC_wplot/wplot<br>  SRC_wplot/wplotc<br>  SRC_structeditor/SRC_ncmsymmetry/ncmsymmetry<br>  SRC_structeditor/SRC_readwrite/readwrite<br>  SRC_structeditor/SRC_struct2mol/struct2mol<br>  SRC_structeditor/SRC_structgen/structgen</div><div dir="ltr">done.</div><div dir="ltr">           </div></div>                                         </div></body>


</html>