<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=utf-8"><div dir="ltr"><div><div><div><div>Thank you Dr Tran<br><br></div><div>Thank you for making the situation clear. <br></div>As you said " this is not important since only the band structure should<br>
be considered after a mBJ calculation".<br></div>Does it mean that we should report optical and other properties using original potentials, i.e. lda/gga/pbe etc and not from mBJ.<br><br></div><div>In many papers including one of my, I got optical and other properties using mBJ potential.<br></div><div><br></div>Kind regards<br></div>Bhamu<br><div><div><div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><br><div class="gmail_quote">On Wed, May 25, 2016 at 4:07 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:tran@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">tran@theochem.tuwien.ac.at</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">The forces are calculated using the potential, therefore<br>
the forces with mBJ are different, and since LDA and mBJ are very<br>
different potentials, then the values can be very different.<br>
Anyway, this is not important since only the band structure should<br>
be considered after a mBJ calculation. It's not necessary to use -fc<br>
with mBJ.<br>
<br>
On Tuesday 2016-05-24 15:30, Dr. K. C. Bhamu wrote:<br>
<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">
Date: Tue, 24 May 2016 15:30:13<br>
From: Dr. K. C. Bhamu <<a href="mailto:kcbhamu85@gmail.com" target="_blank">kcbhamu85@gmail.com</a>><br>
Reply-To: A Mailing list for WIEN2k users <<a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
To: A Mailing list for WIEN2k users <<a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
Subject: Re: [Wien] A small query<br>
<br>
Dear Dr. Tran<br>
<br>
I just compared my lda calculation (for a ternary oxide compound) with mBJ and I got some doubts.<br>
I did converse lda calculation with these parameters.<br>
min -j run_lapw -p -I -i 80 -fc 1.0 -ec 0.00001 -cc 0.0005<br>
save_lapw -d lda<br>
then I run mBJ (0/1/2/3 options) for the follwing parameters:<br>
run_lapw -p -I -i 150 -fc 1.0 -ec 0.00005 -cc 0.0005 -NI<br>
In case of lda the force on Oxygen atom was less than 2<br>
lda.scf::FOR003:   3.ATOM       1.207059       0.000062       0.000000       1.207059 total forces<br>
 while in case of mBJ(2) I got too much different:<br>
mbj2.scf::FOR003:   3.ATOM     100.228357       0.000067       0.000000    -100.228357 total forces<br>
<br>
I checked for struct file and in both cases struct files were same.<br>
<br>
What is the reson for difference in forces?<br>
<br>
Kind regards<br>
<br>
------------------------------------------------<br>
Dr. K. C. Bhamu<br>
(UGC-Dr. D. S. Kothari Postdoc Fellow)<br>
Department of Physics<br>
Goa University, Goa-403 206<br>
India<br>
Mob. No.  +91-9975238952<br>
<br>
On Tue, May 24, 2016 at 5:48 PM, <<a href="mailto:tran@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">tran@theochem.tuwien.ac.at</a>> wrote:<br>
     It's ok since it does not matter at all for the mBJ calculation where<br>
     the files lda.* are located.<br>
     It's only important to use save_lapw after the LDA calculation<br>
     to avoid to mix the LDA and mBJ results in the same scf file.<br>
<br>
<br>
     On Tuesday 2016-05-24 14:04, Dr. K. C. Bhamu wrote:<br>
<br>
           Date: Tue, 24 May 2016 14:04:28<br>
           From: Dr. K. C. Bhamu <<a href="mailto:kcbhamu85@gmail.com" target="_blank">kcbhamu85@gmail.com</a>><br>
           Reply-To: A Mailing list for WIEN2k users <<a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
           To: A Mailing list for WIEN2k users <<a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
           Subject: Re: [Wien] A small query<br>
<br>
           Dear Dr. Tran<br>
           In addition to this query, my mail is just for your confirmation whether I<br>
           did correct or not.<br>
           I optimized atomic positions using lda. Then did "save_lapw -d lda"<br>
           and run mbj as suggested in UG.<br>
           I did not keep lda.scf for mBJ calculation and ran with "run_lapw -p"<br>
<br>
           Does it correct or should I keep lda.scf in pwd for mBJ?<br>
<br>
           Kind regards<br>
           Bhamu<br>
<br>
<br>
           On Tue, May 24, 2016 at 5:27 PM, <<a href="mailto:tran@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">tran@theochem.tuwien.ac.at</a>> wrote:<br>
                This warning concerns the forces which are used for the<br>
                optimization of<br>
                the position of atoms. So, I guess that you are optimizing the<br>
                position<br>
                of atoms, which should not be (and can not be) done with mBJ<br>
                since mBJ<br>
                is only a potential (no associated energy) that should be used<br>
                only for<br>
                band structure. Run a mBJ calculation only at a fixed geometry<br>
                (GGA or experimental, etc.).<br>
<br>
                F. Tran<br>
<br>
                On Tuesday 2016-05-24 13:42, Yedu Kondalu wrote:<br>
<br>
                      Date: Tue, 24 May 2016 13:42:57<br>
                      From: Yedu Kondalu <<a href="mailto:nykondalu@gmail.com" target="_blank">nykondalu@gmail.com</a>><br>
                      Reply-To: A Mailing list for WIEN2k users<br>
                      <<a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
                      To: <a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
                      Subject: Re: [Wien] Warnings in TB-mBJ calculation<br>
                      but not in (LDA/GGA)<br>
                         calculation<br>
<br>
                      Dear sir,<br>
<br>
                         Here are the warning in the SCF file while<br>
                      running TB-mBJ calculation.<br>
<br>
                      grep -e :WARN *.scf<br>
<br>
                      :WARN  FCORE for atom   1 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.1184 mRy/bohr<br>
                      :WARN  FCORE for atom   2 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.3456 mRy/bohr<br>
                      :WARN  FCORE for atom   3 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.2879 mRy/bohr<br>
                      :WARN  FCORE for atom   4 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.1170 mRy/bohr<br>
                      :WARN  FCORE for atom   5 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.2888 mRy/bohr<br>
                      :WARN  FCORE for atom   6 not converged at RMT.<br>
                      Estimated inaccuracy:  0.3401 mRy/bohr<br>
<br>
<br>
                      grep :ENE *.scf<br>
<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.92106926<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.88615877<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.83389420<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.80209222<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.79086646<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77803982<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77699976<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77646892<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77629528<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77610768<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77607630<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77603251<br>
                      :ENE  : ********** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -238077.77601900<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237913.10481970<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237912.58423592<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237912.26250577<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237912.04291171<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.89361189<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.78337650<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.70786686<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.64791205<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.60856615<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.57382848<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.55377846<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.53263201<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.52423892<br>
                      :ENE  : *WARNING** TOTAL ENERGY IN Ry =     <br>
                      -237911.51178371<br>
           ...........................................................................<br>
                      ...........................<br>
           ...........................................................................<br>
                      ...........................<br>
<br>
<br>
                      Best regards<br>
                      N. Yedukondalu<br>
                      ACRHEM, University of Hyderabad.<br>
                      Hyderabad, India.<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
<br>
                        <br>
<br>
<br>
                      On Tue, May 24, 2016 at 3:48 PM, Yedu Kondalu<br>
                      <<a href="mailto:nykondalu@gmail.com" target="_blank">nykondalu@gmail.com</a>> wrote:<br>
                           Dear Prof. P. Blaha and wien2k users,<br>
<br>
                         We are doing electronic structure calculations<br>
                      for MX2 type compound. As a first step we performed<br>
                      the scf calculation and it is completed<br>
                      successfully without any warning in the total<br>
                      energy. As a next step, we did TB-mBJ calculation to<br>
                      get reliable band gap. However, we end up<br>
                      with warnings in scf file for the total energies<br>
                      till end of the calculations.<br>
<br>
                            We also attempted to solve this problem by<br>
                      following some suggestions from you previously for<br>
                      HfO2 system<br>
           (<a href="http://wien.zeus.theochem.tuwien.ac.narkive.com/dXWnRjph/fcore-not-converg" rel="noreferrer" target="_blank">http://wien.zeus.theochem.tuwien.ac.narkive.com/dXWnRjph/fcore-not-converg</a><br>
                      ed-at-rmt-warnings) but still warning remains the<br>
                      same. So, we<br>
                      kindly request you to suggest us a way to solve this<br>
                      problem.<br>
<br>
                      We also attached the structure file for your kind<br>
                      reference. Please find the attachment.<br>
<br>
                      Thanking you sir,<br>
<br>
                      Best regards<br>
                      N. Yedukondalu<br>
                      ACRHEM, University of Hyderabad.<br>
                      Hyderabad, India.<br>
<br>
                         <br>
                        <br>
<br>
                         <br>
<br>
<br>
<br>
<br>
                      --<br>
                                       Regards<br>
                      Neelam Yedukondalu, Research scholar<br>
                          C/O Dr. G. S. Vaitheeswaran<br>
                      ACRHEM, University of Hyderabad<br>
                        Hyderabad - 500046, A.P, India.<br>
                              Mobile No : 9490782129 <br>
<br>
<br>
<br>
                _______________________________________________<br>
                Wien mailing list<br>
                <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
                <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
                SEARCH the MAILING-LIST at: <br>
                <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
<br>
<br>
<br>
<br>
     _______________________________________________<br>
     Wien mailing list<br>
     <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
     <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
     SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
<br>
<br>
<br>
</blockquote>
<br>_______________________________________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
<br></blockquote></div><br></div></div></div></div></div>