<div dir="ltr"><div>Dear Prof Peter and other expert user</div><div><br></div><div>I installed recent Wien2k version on a <span style="font-size:12.8px">SGE resource manager system and job file is take from FAQs as such snd running cases.</span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">1. </span></div><div><span style="font-size:12.8px">In the job.out file I am getting below error message:</span></div><div><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div><span style="font-size:12.8px">**************</span></div><div><div><span style="font-size:12.8px"> LAPW2 END</span></div><div><span style="font-size:12.8px"> SUMPARA END</span></div><div><span style="font-size:12.8px"> CORE  END</span></div><div><span style="font-size:12.8px"> CORE  END</span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:small"> MIXER END</span><br></div></div><div>error: commlib error: got select error (No route to host)</div><div>error: executing task of job 53426 failed: failed sending task to execd@compute-15-21: can't find connection</div><div>[priolkar_gu@k2 ZnCr2O4]$</div><div><br></div><div><br></div><div>2. In the job.err file the followng warning message I am getting very often:</div><div><br></div><div><div>compute-11-13:14.0.Received 1 out-of-context eager message(s) from stray process PID=31840 running on host 172.16.4.58 (LID 0x94, ptype=0x1, subop=0x22, elapsed=0.017s)  (err=49)</div><div>compute-11-13:10.0.Received 1 out-of-context eager message(s) from stray process PID=27582 running on host 172.16.4.145 (LID 0x40, ptype=0x1, subop=0x22, elapsed=0.028s)  (err=49)</div><div>compute-11-13:14.0.Received 1 out-of-context eager message(s) from stray process PID=27591 running on host 172.16.4.145 (LID 0x40, ptype=0x1, subop=0x22, elapsed=0.028s)  (err=49)</div></div><div><br></div><div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)">System specifications:</div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px">sge cluster (</span><span style="font-size:12.8px;white-space:pre-wrap">linuxifc)
</span><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px">with many nodes with each node having 16 core and each core has 4GB RAM (~2GB/ processor), </span><span style="font-size:12.8px;font-family:"times new roman";text-align:justify">40 Gbps Infiniband interconnect</span><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px">. I used "mpiifort" and "mpiicc"   compiler with scalapck, blas, fftd3 and blacs library (without ELPA and LIBXC-3.0.0). </span></div></div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px">Does "</span><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px">, </span><span style="font-size:12.8px;font-family:"times new roman";text-align:justify"><b>40</b> Gbps Infiniband interconnect" is causing problem?</span></div><div style="font-size:12.8px;color:rgb(0,0,0)"><span style="color:rgb(34,34,34);font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Also, How to change the following variable in the job file (for 16 core on each node):</span><br></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">set jobs_per_node=4                 </span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">setenv OMP_NUM_THREADS 1    </span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px"><br></span></div><div style="font-size:12.8px"><span style="font-size:12.8px">Does above number depends on number of k-points ?</span></div><div style="font-size:12.8px"><div><br></div><div><br></div><div><br></div><div><div style="font-size:12.8px">Any kind of solution would make my life easy and reply would be highly appreciated.</div></div><div style="font-size:12.8px"><br></div><div style="font-size:12.8px">Regards</div><div style="font-size:12.8px">Bhamu</div><div><br></div></div>
</div>