<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Dear all,</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Thank you for the replies.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I installed intel parallel studio 2017, which contains a fortran compiler, MKL, Scalapack, blacs, intelmpi, then I configured FFTW3 so that F77 compiler is ifort and enabled mpi. After that i compiled the wien2k programs with no error in sight, so far so good. <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I wanted now to test it on a 4 cores machine Corei3 (I did not want to risk anything with the program already installed in the 32 cores shared memory machine).</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I set 10 kpoints (3 inequivalent atoms for the test) which left me with klist = 1<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I set .machines file like so : <br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">1:localhost:2     #so that 2 cores would take the job<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">The SCF stops with this error in the dayfile :</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">running LAPW1 in parallel mode (using .machines)</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">1 number_of_parallel_jobs</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">       localhost localhost(1)---------------------------------</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Primary job terminated normally, but 1 process returned a non-zero exit code.. Per user-direction, the job has been aborted.-----------</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">---------</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">mpirun detected that one or more processes exited with non-zero status, thus the job to be terminated. The first process to do so was:</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">     Exit code: 127</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">...</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">LAPW2 crashed!</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">FYI : I tried the OMP_NUM_THREADS=2 and it worked ~ 189 % CPU</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">But giving 1 kpoint job to 2 cores has not.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">I red all the mailing list I could find about this subject but none of them really helped.</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">May someone point out where is the problem ?</div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif">Faithfylly,<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:georgia,serif"><br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Mon, Nov 6, 2017 at 11:37 AM, Laurence Marks <span dir="ltr"><<a href="mailto:L-marks@northwestern.edu" target="_blank">L-marks@northwestern.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="auto"><div>Many, many points:</div><div dir="auto"><br><div dir="auto">1) mpi and k-point parallel are different. For mpi you need software, e.g. openmpi or the Intel impi and you need to include this in the configuration. You will need to learn some Linux/computing basics and/or get help from someone local. It is not really appropriate to ask this list to help install mpi.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">2) Increasing rkmax is not as efficient as mpi in my experience, although this depends upon the computer architecture (Peter has the opposite conclusion for small problems).</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">3) mpi allows you to share the load, for instance have 16 cores working on the job not one. 16 cores can be ten times faster than one, although note 2) above. For 300 atoms without mpi your problem may not converge before 2018.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">4) 1 Re atom in fcc Fe has at least cubic symmetry. If you do not enter positions right, symmetry/sgroup won't find the symmetry. I would use cryscon which is cheap, and allows one to generate CIF files with symmetry. There are other codes.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">5) For 300 atoms probably only 1 k-point is needed.</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">6) Walk before you run. Understand a small model first.<br><br><div data-smartmail="gmail_signature" dir="auto">_____<span class=""><br>Professor Laurence Marks<br>"Research is to see what everybody else has seen, and to think what nobody else has thought", Albert Szent-Gyorgi<br><a href="http://www.numis.northwestern.edu" target="_blank">www.numis.northwestern.edu</a></span></div></div><div><div class="h5"><br><div class="gmail_extra" dir="auto"><br><div class="gmail_quote">On Nov 6, 2017 3:54 AM, "Chouaib AHMANI FERDI" <<a href="mailto:ahmaniferdichouaib@gmail.com" target="_blank">ahmaniferdichouaib@gmail.com</a>> wrote:<br type="attribution"><blockquote class="m_8574340781217310609quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div>
<div dir="ltr">
<div>
<div><font face="georgia, serif">Thank you for your feedback.</font></div><div class="m_8574340781217310609quoted-text">
<div><font face="georgia, serif"><br>
</font></div>
<div><font face="georgia, serif">Mr Gavin Abo, </font></div>
<div><font face="georgia, serif">Unfortunately, I do not have access to supercomputer nor to a cluster. I will have to stick with my PC for a while. I thought that MPI was for running jobs on multiple (actual) machines, but since I can
 run lapw1 in multiple cores in my Single PC (edit .machine file), I guess I already have MPI installed. </font></div>
<div><font face="georgia, serif"><br>
</font></div>
</div><div><font face="georgia, serif">Mr Peter Blaha,</font></div>
<div><font face="georgia, serif">I realize that 300 atoms is quite a lot including magnetic atoms such as Fe and RE elements (4f), in fact, 1 cycle took 5 hours to complete, with 40 min for Lapw0, 1h50min for Lapw1 (on 2 cores) for up
 and down and 16min for Lapw2 (2 cores) for up and down. </font></div>
<div><font face="georgia, serif">I think the problem is that I am stuck with klist : 2</font></div>
<div><font face="georgia, serif"><br>
</font></div>
<div><font face="georgia, serif">and if I increase kpoints, so that for example 10 machines would take the job, (klist 10) I think that Lapw0 will take too long since I cannot run it in multiple cores.</font></div>
<div><font face="georgia, serif"><br>
</font></div>
<div><font face="georgia, serif">About the structure, the unit cell without doping consists of 56 atoms with 16 atoms of Fe (fcc lattice) the doping consists of 0.01 RE + 0.01 Re element doping so that the smallest supercell would be one
 with 96 Fe atoms. </font></div>
<div><font face="georgia, serif">I will consider your advice and hope that results from doping smaller supercell would help explaining the experimental data we obtained.</font></div>
<div><font face="georgia, serif"><br>
</font></div>
<div><font face="georgia, serif">Faithfully,</font></div>
</div>
<div class="gmail_extra"><br>
<div class="gmail_quote"><br>
</div>
</div>
</div>
<img style="width:0;max-height:0;overflow:hidden">
</div>

</blockquote></div><br></div></div></div></div></div>
<br>______________________________<wbr>_________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.<wbr>at</a><br>
<a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.<wbr>ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/<wbr>wien@zeus.theochem.tuwien.ac.<wbr>at/index.html</a><br>
<br></blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#0b5394" face="georgia, serif">AHMANI FERDI Chouaïb</font></div><div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#0b5394" face="georgia, serif">"Laboratoire Matériaux Nanomatériaux Nanomagnétisme </font></div><div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#0b5394" face="georgia, serif">  et Enseignement des Sciences"<br></font></div><div dir="ltr"><font style="background-color:rgb(255,255,255)" color="#0b5394" face="georgia, serif">Ecole Normale Supérieure</font></div><div dir="ltr"><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font color="#0b5394"><font face="georgia, serif">Université Mohammed V, </font><span style="font-family:georgia,serif;font-size:12.8px">Rabat. </span></font></span></div><div dir="ltr"><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font color="#0b5394"><font face="georgia, serif">Tel : </font><font face="trebuchet ms, sans-serif">+212 6 94 59 57 60</font></font></span></div><div><span style="background-color:rgb(255,255,255)"><font color="#0b5394"><br></font></span></div><div><font face="trebuchet ms, sans-serif"><br></font></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>