<div dir="ltr">Actually I found it when doing it step by step, although the error was only in the output. Peter is the expert on this....</div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, May 15, 2018 at 11:32 AM, Fecher, Gerhard <span dir="ltr"><<a href="mailto:fecher@uni-mainz.de" target="_blank">fecher@uni-mainz.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Strange, just as a diagnostic<br>
it seems the error appears only when running batch initialisation<br>
I do not see it when using step by step initialisation in w2web<br>
or running x symmetry directly from the command line<br>
<br>
also strange, when converting the structure to P1 then sgroup finds space group 146 instead of 148<br>
but the batch initialisation has the same problem (indeed after accepting the structure from sgroup)<br>
again, no error from x symmetry only from batch initialisation<br>
<br>
Ciao<br>
Gerhard<br>
<br>
DEEP THOUGHT in D. Adams; Hitchhikers Guide to the Galaxy:<br>
"I think the problem, to be quite honest with you,<br>
is that you have never actually known what the question is."<br>
<br>
==============================<wbr>======<br>
Dr. Gerhard H. Fecher<br>
Institut of Inorganic and Analytical Chemistry<br>
Johannes Gutenberg - University<br>
55099 Mainz<br>
and<br>
Max Planck Institute for Chemical Physics of Solids<br>
01187 Dresden<br>
______________________________<wbr>__________<br>
Von: Wien [<a href="mailto:wien-bounces@zeus.theochem.tuwien.ac.at">wien-bounces@zeus.theochem.<wbr>tuwien.ac.at</a>] im Auftrag von Bartek Wiendlocha [<a href="mailto:bwiendlocha@tlen.pl">bwiendlocha@tlen.pl</a>]<br>
Gesendet: Dienstag, 15. Mai 2018 15:20<br>
An: <a href="mailto:wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">wien@zeus.theochem.tuwien.ac.<wbr>at</a><br>
Betreff: [Wien] error in symmetry step (not seen by sgroup)<br>
<br>
Dear Wien2k Users & Developers,<br>
<br>
I have a strange problem with the symmetry step (during the initialization procedure), seems not to be reported to the mailing list before.<br>
My original system was rather a big one, so I created a smaller struct file to track the error (attached).<br>
Struct file was checked with sgroup before initialization, there are no problems with rounding of positions as well.<br>
<br>
During the initialization, symmetry reports the error:<br>
---------- ERROR ------------------<br>
ERROR: (multiplicity of atom           2 )*(number of pointgroup-operations)<br>
ERROR: is NOT = (number of spacegroup-operations)<br>
ERROR: MULT:           1  ISYM:          12  NSYM           6<br>
ERROR: Check your struct file with    x sgroup<br>
---------- ERROR ------------------<br>
<br>
Space group is #148 R-3 with 6 symmetry operations. In the attached struct file there are 2 inequivalent positions: (6f) and (1a) =(0,0,0). If you remove the 1a atom, symmetry has no problems, but when (1a) is present, error pops up. It looks like symmetry wants to have 12 symm operations, instead of 6 (?).<br>
Is there an error in the symmetry program or how can I deal with such a structure?<br>
<br>
best,<br>
<br>
Bartek Wiendlocha<br>
Department of Condensed Matter Physics<br>
AGH University of Science and Technology<br>
Krakow, Poland<br>
<br>
______________________________<wbr>_________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.<wbr>at</a><br>
<a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__zeus.theochem.tuwien.ac.at_mailman_listinfo_wien&d=DwICAg&c=yHlS04HhBraes5BQ9ueu5zKhE7rtNXt_d012z2PA6ws&r=U_T4PL6jwANfAy4rnxTj8IUxm818jnvqKFdqWLwmqg0&m=9sFYvMHWQPxxlBbFjX6aqVekcH0IspjZ-VNidVjyZqI&s=SH-n4bK9eJe_2DkJ0sJ0bgi58SoJp2VKU-Cd9ytGQgQ&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.proofpoint.<wbr>com/v2/url?u=http-3A__zeus.<wbr>theochem.tuwien.ac.at_mailman_<wbr>listinfo_wien&d=DwICAg&c=<wbr>yHlS04HhBraes5BQ9ueu5zKhE7rtNX<wbr>t_d012z2PA6ws&r=U_<wbr>T4PL6jwANfAy4rnxTj8IUxm818jnvq<wbr>KFdqWLwmqg0&m=<wbr>9sFYvMHWQPxxlBbFjX6aqVekcH0Isp<wbr>jZ-VNidVjyZqI&s=SH-n4bK9eJe_<wbr>2DkJ0sJ0bgi58SoJp2VKU-<wbr>Cd9ytGQgQ&e=</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="https://urldefense.proofpoint.com/v2/url?u=http-3A__www.mail-2Darchive.com_wien-40zeus.theochem.tuwien.ac.at_index.html&d=DwICAg&c=yHlS04HhBraes5BQ9ueu5zKhE7rtNXt_d012z2PA6ws&r=U_T4PL6jwANfAy4rnxTj8IUxm818jnvqKFdqWLwmqg0&m=9sFYvMHWQPxxlBbFjX6aqVekcH0IspjZ-VNidVjyZqI&s=n6NCHyy6hmQyqWUCeF9VzdK104aqjmSqxgxVO_Ip_5M&e=" rel="noreferrer" target="_blank">https://urldefense.proofpoint.<wbr>com/v2/url?u=http-3A__www.<wbr>mail-2Darchive.com_wien-<wbr>40zeus.theochem.tuwien.ac.at_<wbr>index.html&d=DwICAg&c=<wbr>yHlS04HhBraes5BQ9ueu5zKhE7rtNX<wbr>t_d012z2PA6ws&r=U_<wbr>T4PL6jwANfAy4rnxTj8IUxm818jnvq<wbr>KFdqWLwmqg0&m=<wbr>9sFYvMHWQPxxlBbFjX6aqVekcH0Isp<wbr>jZ-VNidVjyZqI&s=<wbr>n6NCHyy6hmQyqWUCeF9VzdK104aqjm<wbr>SqxgxVO_Ip_5M&e=</a><br>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">Professor Laurence Marks</span><br></div><div dir="ltr"><span style="font-size:12.8px">"Research is to see what everybody else has seen, and to think what nobody else has thought", </span><span style="font-size:12.8px">Albert Szent-Gyorgi</span><br><a href="http://www.numis.northwestern.edu" target="_blank">www.numis.northwestern.edu</a> ; <span style="font-size:12.8px">Corrosion in 4D: </span><a href="http://MURI4D.numis.northwestern.edu" style="font-size:12.8px" target="_blank">MURI4D.numis.northwestern.edu</a><div><span style="font-size:12.8px">Partner of the CFW 100% program for gender equity, </span><a href="http://www.cfw.org/100-percent" style="font-size:12.8px" target="_blank">www.cfw.org/100-percent</a></div><div>Co-Editor, Acta Cryst A</div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
</div>