<div dir="auto">N.B., This may be due to you loading different modules, if that is how your cluster is setup. Check that the same was used for compilation & execution.</div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr">On Wed, Jan 9, 2019, 20:16 Laurence Marks <<a href="mailto:L-marks@northwestern.edu">L-marks@northwestern.edu</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="auto"><div>Try "ldd lapw0" to see what shared libraries are being used, then edit your compilation options to do static compilation. Depending upon what compiler your have the options will change; do "ifort --help | more" or "ifort --help > Fort.txt" and read.... (or gfortran, etc).</div><div dir="auto"><br></div><div dir="auto">At least for the non-mpi you can build lapw0 & others without any shared libraries. I have never seen this fail, but it might.<br><br><div class="gmail_quote" dir="auto"><div dir="ltr">On Wed, Jan 9, 2019, 19:58 Lawal Mohammed <<a href="mailto:mohammedlawal08@yahoo.com" target="_blank" rel="noreferrer">mohammedlawal08@yahoo.com</a> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">



<div>
<div class="m_8331282392988095630m_-7074460002333152142ydp178f5d66yahoo-style-wrap" style="font-family:verdana,helvetica,sans-serif">
<div><font size="2">Dear Developers and Users,</font></div>
<div><font size="2"><br>
</font></div>
<div><font size="2">I am facing a problem and need your help.</font></div>
<div><font size="2">The issue is an error when I submitted a job on cluster machine. The error message is:  </font></div>
<div><font size="2"><br>
</font></div>
<div><font size="2"><span>
<div>Calculating Bismuthtest1 in /home/username/WIEN2k/Bismuthtest1</div>
<div>on node5 with PID 21645</div>
<div>using WIEN2k_18.2 (Release 17/7/2018) in /software/wien2k-18.2</div>
<div><br>
</div>
<div>    start       (Thu Jan 10 09:48:12 CST 2019) with lapw0 (100/99 to go)</div>
<div><br>
</div>
<div>    cycle 1     (Thu Jan 10 09:48:12 CST 2019)  (100/99 to go)</div>
<div><br>
</div>
<div>>   lapw0  -p   (09:48:12) starting parallel lapw0 at Thu Jan 10 09:48:12 CST 2019</div>
<div>-------- .machine0 : processors</div>
<div>running lapw0 in single mode</div>
<div>0.022u 0.036s 0:00.08 62.5%     0+0k 0+56io 0pf+0w</div>
<div>error: command   /software/wien2k-18.2/lapw0para lapw0.def   failed</div>
<div>>   stop error</div>
<div><br>
</div>
</span></font></div>
<div><font size="2"><span>
<div style="font-family:verdana,helvetica,sans-serif">In the output file the error is:</div>
<div style="font-family:verdana,helvetica,sans-serif">lapw0: relocation error: lapw0: symbol kmp_aligned_malloc, version VERSION not defined in file libiomp5.so with link time reference<br clear="none">
grep: *scf1*: No such file or directory<br clear="none">
<div>grep: lapw2*.error: No such file or directory</div>
</div>
</span><br>
</font></div>
<div><font size="2">Many thanks to Gavin for pointing out that the error was due to clash between other libraries with the </font><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2"> Intel Fortran library. However, after
 I reported the issue, system admin confirmed that the environmental variables was okay.</font> <font size="2">Any help to rectify this issue is highly appreciated.</font></span></div>
<div><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2"><br>
</font></span></div>
<div><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2">I will provide addition information if needed.</font></span></div>
<div><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2"><br>
</font></span></div>
<div><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2">Thanks alot for your time.</font></span></div>
<div><span style="font-family:Helvetica Neue,Helvetica,Arial,sans-serif"><font size="2">With kind regards.</font></span></div>
<div class="m_8331282392988095630m_-7074460002333152142ydp178f5d66signature" style="font-size:16px">
<p style="font-family:verdana,helvetica,sans-serif;font-size:16px"><b><font size="3" face="verdana, helvetica, sans-serif"><i>Lawal
<br>
</i></font></b></p>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div></div></div>
</blockquote></div>