<div dir="ltr"><div>yes sir. still the problem is there. No issue sir I can manually see the structures. <br></div><div><br></div><div><br></div><div>Thanking you <br></div><div>Indranil<br> </div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Apr 29, 2019 at 8:37 PM Peter Blaha <<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Did you do the killing and restart of w2web ???<br>
<br>
Am 29.04.2019 um 14:24 schrieb Indranil mal:<br>
> By using the command line "xcrysden --wien_struct case.struct" I can see <br>
> the structures and the view structure button is also showing in w2web. <br>
> But When click on the view structure button "Requires X-Windows system <br>
> ... " message is coming.<br>
> <br>
> Thanking you<br>
> <br>
> Indranil<br>
> <br>
> On Fri, Apr 26, 2019 at 11:02 AM Peter Blaha <br>
> <<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a> <mailto:<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a>>> wrote:<br>
> <br>
>     change into a directory where you have a case.struct file.<br>
>     Can you open it using:<br>
> <br>
>     xcrysden --wien_struct case.struct<br>
> <br>
>     If yes, then xcrysden is properly installed. If you do  not see the<br>
>     view<br>
>     structure button in w2web, you have to kill w2web and restart it again:<br>
> <br>
>     ps -ef|grep w2web   #  this gives you the "PID" of w2web, a number on<br>
>     the left side<br>
>     kill PID            #<br>
> <br>
>     and repeat the ps command until you do not find w2web anymore. Then<br>
>     start w2web again by typing:<br>
> <br>
>     w2web<br>
> <br>
>     Regards<br>
> <br>
>     Am 26.04.2019 um 06:00 schrieb Indranil mal:<br>
>      > I have followed your suggestion and it is working except the<br>
>     xcrysden is<br>
>      > not linked, can not view structures.<br>
>      ><br>
>      > dps@dps-lab:~$ whereis xcrysden<br>
>      > xcrysden: /usr/bin/xcrysden /usr/lib/xcrysden /usr/share/xcrysden<br>
>      > /home/dps/WIEN2K/xcrysden /usr/share/man/man1/xcrysden.1.gz<br>
>      ><br>
>      > XCRYSDEN_TOPDIR=/usr/share/xcrysden<br>
>      > XCRYSDEN_SCRATCH=/home/dps/xcrys_tmp<br>
>      ><br>
>      > unable to edit the top directory. However I have installed<br>
>     xcrysden from<br>
>      > UBUNTU software library.<br>
>      ><br>
>      ><br>
>      > Thanking you<br>
>      ><br>
>      > Indranil<br>
>      ><br>
>      ><br>
>      > On Tue, Apr 23, 2019 at 6:41 PM Peter Blaha<br>
>      > <<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>     <mailto:<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:pblaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">pblaha@theochem.tuwien.ac.at</a>>>> wrote:<br>
>      ><br>
>      >     I suggest that you first do only the sequential installation.<br>
>      ><br>
>      >     For this (and for your hardware) you don't need mpi,<br>
>     scalapack or elpa.<br>
>      ><br>
>      >     Change into SRC_lapw0 and inspect the compile.msg file in<br>
>     more detail.<br>
>      >     You may see more informative messages then what you posted.<br>
>      ><br>
>      >     You can also recompile again simply by typing "make" in<br>
>     SRC_lapw0.<br>
>      ><br>
>      >     PS: If this was the only error in siteconfig after<br>
>     compilation of all<br>
>      >     programs, it might be your libxc installation. (remove<br>
>     -DLIBXC, and the<br>
>      >     corresponding includes and libraries in the Makefile of<br>
>     SRC_lapw0.<br>
>      ><br>
>      >     On 4/23/19 10:00 AM, Indranil mal wrote:<br>
>      >      > I am using a PC with intel i7 32GB RAM and 2TB HDD with<br>
>     UBUNTU 18.04<br>
>      >      > LTS. I have installed OpenBLAS-0.2.20 and using GNU<br>
>     FORTRAN and c<br>
>      >      > compiler and my settings for compiler/Linker , Libraries<br>
>     are as<br>
>      >     followed<br>
>      >      ><br>
>      >      >   Current settings:<br>
>      >      >    O   Compiler options:        -ffree-form -O2<br>
>      >     -ffree-line-length-none<br>
>      >      >    L   Linker Flags:            $(FOPT)<br>
>      >      >    P   Preprocessor flags       '-DParallel'<br>
>      >      >    R   R_LIBS (LAPACK+BLAS):    -llapack -lblas -lpthread<br>
>      >      >    X   LIBX options:            -DLIBXC -I/opt/etsf/include<br>
>      >      >        LIBXC-LIBS:              -L/opt/etsf/lib/ -lxcf03 -lxc<br>
>      >      ><br>
>      >      > I have installed FFTW3 and mpi but could not install ELPA<br>
>     getting<br>
>      >     the<br>
>      >      > error " No usable BLACS found. If installed in a<br>
>     non-standard place,<br>
>      >      > please specify suitable LDFLAGS and FCFLAGS as arguments to<br>
>      >     configure".<br>
>      >      > And that is why I did not configure the parallel computing.<br>
>      >      ><br>
>      >      > When I am trying to compile the getting the following<br>
>     error and<br>
>      >     attached<br>
>      >      > the compile.msg file. Please help me to install WIEN2K in<br>
>     my system.<br>
>      >      ><br>
>      >      > done.<br>
>      >      ><br>
>      >      > Compile time errors (if any) were:<br>
>      >      > SRC_lapw0/compile.msg:collect2: error: ld returned 1 exit<br>
>     status<br>
>      >      > SRC_lapw0/compile.msg:make[1]: *** [lapw0] Error 1<br>
>      >      > SRC_lapw0/compile.msg:make: *** [seq] Error 2<br>
>      >      ><br>
>      >      > Thanking you<br>
>      >      ><br>
>      >      > Indranil<br>
>      >      ><br>
>      >      ><br>
>      >      > _______________________________________________<br>
>      >      > Wien mailing list<br>
>      >      > <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>      >     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>>><br>
>      >      > <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>      >      > SEARCH the MAILING-LIST at:<br>
>      ><br>
>     <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
>      >      ><br>
>      ><br>
>      >     --<br>
>      ><br>
>      >                                             P.Blaha<br>
>      >   <br>
>       --------------------------------------------------------------------------<br>
>      >     Peter BLAHA, Inst.f. Materials Chemistry, TU Vienna, A-1060<br>
>     Vienna<br>
>      >     Phone: +43-1-58801-165300             FAX: +43-1-58801-165982<br>
>      >     Email: <a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>      >     <mailto:<a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a>>>    WIEN2k: <a href="http://www.wien2k.at" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.wien2k.at</a><br>
>      >     WWW: <a href="http://www.imc.tuwien.ac.at/TC_Blaha" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.imc.tuwien.ac.at/TC_Blaha</a><br>
>      >   <br>
>       --------------------------------------------------------------------------<br>
>      >     _______________________________________________<br>
>      >     Wien mailing list<br>
>      > <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>>><br>
>      > <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>      >     SEARCH the MAILING-LIST at:<br>
>      ><br>
>     <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
>      ><br>
>      ><br>
>      > _______________________________________________<br>
>      > Wien mailing list<br>
>      > <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>      > <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>      > SEARCH the MAILING-LIST at:<br>
>     <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
>      ><br>
> <br>
>     -- <br>
>     --------------------------------------------------------------------------<br>
>     Peter BLAHA, Inst.f. Materials Chemistry, TU Vienna, A-1060 Vienna<br>
>     Phone: +43-1-58801-165300             FAX: +43-1-58801-165982<br>
>     Email: <a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a><br>
>     <mailto:<a href="mailto:blaha@theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">blaha@theochem.tuwien.ac.at</a>>    WIEN2k: <a href="http://www.wien2k.at" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.wien2k.at</a><br>
>     WWW:<br>
>     <a href="http://www.imc.tuwien.ac.at/tc_blaha-------------------------------------------------------------------------" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.imc.tuwien.ac.at/tc_blaha-------------------------------------------------------------------------</a><br>
> <br>
> <br>
>     _______________________________________________<br>
>     Wien mailing list<br>
>     <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a> <mailto:<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a>><br>
>     <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
>     SEARCH the MAILING-LIST at:<br>
>     <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
> <br>
> <br>
> _______________________________________________<br>
> Wien mailing list<br>
> <a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
> <a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
> SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
> <br>
<br>
-- <br>
Peter Blaha<br>
Inst.Materials Chemistry<br>
TU Vienna<br>
Getreidemarkt 9<br>
A-1060 Vienna<br>
Austria<br>
+43-1-5880115671<br>
_______________________________________________<br>
Wien mailing list<br>
<a href="mailto:Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at" target="_blank">Wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at</a><br>
<a href="http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien" rel="noreferrer" target="_blank">http://zeus.theochem.tuwien.ac.at/mailman/listinfo/wien</a><br>
SEARCH the MAILING-LIST at:  <a href="http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html" rel="noreferrer" target="_blank">http://www.mail-archive.com/wien@zeus.theochem.tuwien.ac.at/index.html</a><br>
</blockquote></div>